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2015年:省疾控中心授予創新發展等先進集體

        團市委等授予優秀志愿服務集體

2014年:中國疾病預防控制中心麻風病控制中心授予2013-2014年全國麻風病防治管理信息系統工作先進集體

        省疾控中心授予急性傳染病監測等先進集體

        市總工會授予2014年湖州市五一勞動獎狀

        省心血管病防治研究中心授予浙江省“中國高血壓患者教育”小品比賽二等獎

2013年:國家衛計委授予人感染H7N9禽流感疫情防控工作中表現突出的單位

        省衛生廳授予浙江省疾病預防控制工作先進集體

        人感染H7N9禽流感防控工作先進集體

2012年:省衛生廳授予浙江省結核病防治工作先進集體

        省疾控中心授予疫苗管理先進集體

        市未成年人保護委員會授予優秀青少年維權崗

2011年:省衛生廳授予2011年省醫藥衛生科技獎

        省愛衛辦授予農村水質衛生監測和中央農村改廁先進集體

2010年:省衛生廳授予浙江省疾病預防控制工作先進集體

        省衛生廳授予浙江省衛生應急工作先進集體

        省衛生系統政促會疾控專業委員會授予思想政治工作先進集體

2009年:省疾控中心授予全省市級疾控中心應急演練先進集體

        省衛生系統政促會疾病預防控制專業委員會授予全省疾控系統思想政治工作先進集體

        團市委授予度市級先進團支部

2008年:中共湖州市委授予“市抗震救災先進單位”;

        省疾控中心授予“省疾控系統抗震救災先進集體”;

        省總工會授予“省抗震救災工人先鋒號”。

2007年:省衛生廳授予“公共衛生應急工作先進集體”;

        省疾控中心授予“2006年度浙江省疫苗管理先進集體”;

        省疾控中心授予“浙江省2006年度霍亂防控工作先進集體”;

        省疾控中心授予“2006年度浙江省食品污染物、食源性病原菌監測先進單位”;

        省疾控中心授予“2006年浙江省社區健康教育試點工作先進集體”;

        省疾控中心授予“省社區營養健康知識和技能比賽團體一等獎”;

        省疾控中心授予“傳染病和突發公共衛生事件報告管理工作先進集體”;

        省衛生廳、省醫學會授予“浙江省醫藥衛生科技創新獎一等獎”;

        省血吸蟲病防治中心授予“浙江省2006年度血吸蟲病防治業務工作先進集體”;

2006年:衛生部授予“全國結核病防治工作先進集體”;

        省委省政府授予“省級文明單位”;

        省疾控中心授予“浙江省2006年度流感監測工作先進集體”

        市委市政府授予“2005年度湖州市‘四城聯創’先進單位”;

2005年:浙江省衛生廳授予“浙江省結核病防治工作先進集體”;

        省衛生廳授予“浙江省公共衛生應急先進集體”;

        省衛生廳授予“浙江省2005年度衛生監測區先進單位”;

        省疾控中心授予“全省傳染病和突發公共衛生事件報告管理先進集體”;

        省疾控中心授予“瘧疾防治監測工作一等獎”;

2004年5月20日:獲得浙江省衛生廳批準的“職業衛生技術服務資質證書”(證書號:浙衛職技字(2004)第012號);

2003年:浙江省衛生廳、浙江省衛生政研會授予“省衛生系統思想政治工作先進單位”;

        浙江省愛衛會授予“浙江省衛生先進單位”;

        中共湖州市委、市政府授予“‘四城聯創’先進集體”;

2002年:中共湖州市委、市政府授予“2001-2002年度市級文明單位”稱號;

        中共湖州市衛生局委員會授予“2001-2002年度先進基層黨組織”稱號;

        中共湖州市衛生局委員會授予“2001創建文明行業優勝單位”稱號;

2001年:衛生部授予“全國結核病防治先進集體”;

        衛生部授予“全國消滅骨髓灰質炎先進集體”

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